La thématique prioritaire numéro 1 porte sur : Sciences de la vie, génomique et biotechnologie pour la santé (LifeSciHealth).
Le projet VIZIER a pour objet le secteur de recherche : i) Génomique avancée et son application en santé humaine a) Connaissances fondamentales et outils de base en génomique fonctionnelle applicables à tous les organismes, et plus particulièrement l’objectif indiqué par l’action de recherches ciblée de Génomique Structurale (LSH-1.1.2) est « de permettre aux chercheurs de déterminer plus efficacement et à un taux plus élevé que ce qui est actuellement faisable, la structure tridimensionnelle des protéines et autres macromolécules, détermination qui est importante pour établir la fonction de protéines et essentielle pour la conception de médicaments. »
Le sujet précis auquel le projet VIZIER répond est LSH-2003-1.1.2-1 : Biologie structurale comparative de la réplication virale - PROJET INTÉGRÉ (PI) : « L’action principale devra porter sur le développement de nouvelles approches, outils et technologies dans le but d’obtenir des données complètes sur la structure des machineries réplicatives des virus à ARN et ce pour faciliter l’identification de nouvelles cibles potentielles de médicaments. »
Les objectifs de VIZIER, en tant que projet intégré, sont précisément de répondre à ce groupe d’objectifs :
Le champ de VIZIER correspond complètement au domaine d’action de la priorité 1 puisque ses domaines d’intérêt sont des virus pathogènes, une menace constante et perpétuelle pour la santé et la sécurité humaines. Le choix des familles et des souches de virus, a été pensé pour couvrir largement l’univers connu des virus à ARN.
VIZIER accomplit parfaitement les objectifs de LSH-1.1.2 : c’est un programme de Génomique Structurale dans lequel les produits finaux sont des structures 3D de protéines obtenues grâce aux méthodes améliorées de HTP. Les structures 3D permettront de concevoir des molécules actives pour évaluer la validité des cibles dans un procédé de validation.
VIZIER se concentrera sur les enzymes de réplication et leurs protéines auxiliaires (machineries réplicatives) des virus à ARN et ainsi répond exactement à l’appel LSH-2003-1.1.2-1. De nouvelles méthodes et stratégies seront développées et appliquées dans chacune de ses 5 sections scientifiques pour traiter les milliers de cibles ainsi que la grande quantité d’information structurale générée. Le choix des familles et des souches de virus a été fait à la lumière de notre connaissance actuelle des mécanismes de réplication des différentes familles virales. Enfin, la connaissance acquise sur les structures 3D sera employée pour concevoir des inhibiteurs qui seront validés biochimiquement, structurellement et in vitro. On s’attend à ce que ces inhibiteurs soient des modèles de départ pour la conception de médicaments, un débouché qui sera proposé aux partenaires industriels au sein de la plateforme industrielle.
VIZIER a des liens forts avec d’autres programmes Européens et nationaux. Les partenaires français (1 et 4) ont été impliqués dans le programme de GENOPOLES du ministère de la recherche ce qui leur a permis d’acquérir la majeure partie de l’équipement nécessaire. Le partenaire 12 a été financé en tant que service national britannique pour l’expression de protéines (UOXF, OPPF). Le partenaire 25 a été financé par le programme de génomique structurale suédois. Les partenaires 1, 12, 13 et 25 font partie du projet intégratif SPINE (FP5) de l’UE, conçu comme un Projet Intégré « pilote » pour le FP6. Une telle participation assure qu’une connaissance suffisante des problèmes de gestion scientifique et administrative sera présente dans le projet VIZIER.
Cependant, un soin particulier sera pris pour éviter la duplication inutile des tâches ainsi que pour s’assurer que les problèmes de budget soient traités d’une façon commode pour les partenaires qui participent à des PI différents ayant des thématiques communes (méthodes ou cibles). Ceci sera relativement facile à gérer grâce à l’exemple de SPINE dans lequel les deux tâches relatives à la détermination de structure de protéines virales sont coordonnées par les partenaires 1 et 12 de VIZIER qui rendront explicite le rôle de chaque IP dans leur travail. La formation et la mobilité aussi bien que la communication sont des points clefs de VIZIER grâce à sa structure centralisée avec des satellites ainsi qu’au concept du « Laboratory Without Walls ». En résumé, VIZIER contribuera d’une façon très directe et étendue aux objectifs prioritaires de la Commission des sciences de la vie, génomique et biotechnologie pour la santé (LSH), tout comme à l’objectif plus large de la Commission « pour augmenter la compétitivité européenne de la recherche en unissant les activités de recherches nationales fragmentées en une alliance européenne de la recherche ».
